La NAP Antrema est très riche en biodiversité animale.
Cinq espèces de lémuriens ont été trouvées : Propithecus coronatus ;Eulemur mongoz, Eulemur fulvus rufus ; Microcebus murinus et Lepilemur eclii.
Des micro-mammifères, comme Tenrec ecaudatus (Tenrecidae)
Des reptiles; 18 espèces ont été trouvées dont : Sanzinia madagascarensis, Phelsuma madagascarensis, Liophidium torquatum, Leioheterodon madagascarensis, Acrantopis dumerlii et Crocodylus nilotycus et Brookesia brygooi sont les plus connues.
Des oiseaux, en particulier, les oiseaux d’eau qui habitent au bord des lacs et des ruisseaux.
Des poissons On y rencontre aussi des poissons d’eau douce et des poissons de mer. Les lacs de la NAP sont riches en poissons endémiques comme
